Das Münzkabinett beherbergt rund 100’000 Objekte, darunter neben Münzen und Medaillen auch Banknoten, Wertschriften, Kreditkarten sowie Münzprägestempel. Das zeitliche Spektrum reicht von keltischen Prägungen bis zu den aktuell gültigen Münzen und Banknoten. Das Museum ist die einzige Institution, die systematisch Münzen aus der gesamten Schweiz sammelt. Mit ca. 30’000 Stücken ist die Sammlung schweizerischer Münzen die wohl grösste Sammlung schweizerischer Prägungen überhaupt.

Das Museum besitzt die bedeutendste Siegelsammlung der Schweiz und eine der grössten Europas; dank ihrer systematischen und übersichtlichen Gliederung ist sie zudem benutzerfreundlich angelegt und leicht zugänglich. Die Sammlung beinhaltet rund 80’000 Objekte und setzt sich zusammen aus Originalsiegeln, Lackabdrücken und Gipsabgüssen. Dazu kommen etwa 800 Siegelstempel (Petschafte) aus verschiedenen Materialien.